Het park beslaat het centrale deel van het kalkmassief Pieniny met de bergtop Trzy Korony (982 m) en de schilderachtige Dunajec kloof. Dit bergmassief is bijzonder vanwege zijn gevarieerde vormen. Schilderachtige steile rotsformaties en slingerende bochtige hellingen, rijzen honderden meters uit boven de rivier Dunajec.Toeristen kunnen dit bewonderen tijdens een tocht per vlot. De vegetatie bestaat hier uit talrijke inheemse en relicte plantensoorten, zoals de “mniszek pieninski” (Taraxacum pieninicum) en “pszonak pieninski” (Erysimum pieninicum). Dominant zijn hier de beuken- en naaldbossen. De kale bergkammen en rotsplateaus zijn begroeid met relicte dennenbosjes. Bijzonder rijk zijn hier de dieren- en insectenwereld waaronder zeldzame vlinders zoals de Apollovlinder, koninginnepage en koningpage. Onder strenge bewaking zijn amfibieën en reptielen zoals: gevlekte salamander, gewone adder en andere. Zoogdieren zijn hier voornamelijk knaagdieren en 17 soorten vleermuizen. Onder de vogels onderscheidt zich de pomurnik.